※醫學系
醫學系畢業取得醫師執照後，可選擇開始執業，或是繼續就讀研究所。於臨床醫學部分，可選考醫學院臨床醫學研究所進修；於基礎醫學部分則可選考醫學院各學科研究所進修；如對醫療管理有興趣者可於公共衛生學院選考醫療機構管理研究所、衛生政策與管理研究所進修。除以上研究所外，本學系畢業生亦可攻讀其他領域研究所，如法律、電機、企管…等研究所，可以同時在醫學和其他領域方面有卓越的發展。
本學系同學畢業後可進入醫學中心接受紮實的住院醫師訓練，進而成為專科主治醫師，同時也可在區域教學醫院以上擔任基礎或臨床教學的教師或研究員；未來亦可投身進入公共衛生相關領域，成為政府衛生行政官員或大型醫院之專業管理人；另外亦可進入目前最熱門的生物科技產業進行研發工作，成為明日之星。
※呼吸治療學系
就業管道：
● 報考專門職業及技術人員高等考試，取得呼吸治療師證照，至各大公私立醫療機構擔任呼吸治療師、肺功能檢查技術師等，日後亦可擔任居家呼吸治療師
● 呼吸治療器材的推廣及銷售
● 呼吸治療技術改善及發展
相關專業證照：
● 呼吸治療師證照
進修領域：
● 國內外重症暨呼吸治療研究所、醫學工程研究所、醫學科學研究所、資訊管理研究所、醫務管理研究所等相關碩博士班課程